中国医学科学院病原生物学研究所(以下简称 “病原所”〉成立于2006年，病原所是卫生行业中唯一专业从事病原生物学研究的国家级科研单位。建所至今，病原所始终坚持 “育人才、建体系、活机制、造环境、稳发展、求创新”的发展原则，采取“边建设、边发展、边积累”的实施策略，积极进取，锐意创新，各项工作逐步展开，研究所的发展日新月异。截至目前，病原所有编制内员工100余人，其中国家杰出青年基金获得者4人、新世纪百千万人才工程国家级人选4人、国家“万人计划”第一批科技创新领军人才1人、协和特聘教授8人、高级专业技术职称38人、研究生导师35人。

病原所的定位：根据国家中长期科技发展规划，面向国家重大需求，瞄准国际科技发展前沿，突出卫生行业特色。通过建立全新的运行机制、建设一流的人才队伍、发展一流的学科水平、构建一流的技术平台，增强创新能力，解决关键问题，发展核心技术，引领产业发展，保障人民健康。

病原所的任务：开展基础、应用基础和应用性研究，为相关领域研究水平的提升提供支撑；为重大公共卫生事件防控提供保障；为相关产业发展提供基础。同时开展政策研究及教学工作；为相关领域培养高级人才。

病原所的研究领城：开展病原学、生物学、流行病学、免疫学、形态学、遗传学、基因组学、蛋白质组学、生物信息学、结构生物学等多学科研究以及诊断、预防技术与产品的研发等。

病原所自成立以来，按照“定位明确、整体规划、不断创新、 稳步推进”的建所思路，以实验空间、技术体系、学科建设、人才队伍、对外合作、机制体制和所院学问等为工作重点。目前，10,000平方米现代化、标淮化装饰的空间，为新址建设过渡期间的实验和办公提供了场地；3,000多台件高精尖设备，搭建了基因组学、蛋白质组学、生物信息学、免疫学、细胞生物学、分子生物学、形态学、结构生物学等多种前沿和传統技术的硬件平台；一批来自国内外的中青年优秀人才，逐步形成了结构合理、层次分明、富有活力和发展潜能的研究和管理团队；通过实体联合、资源基地、项目合作、战略联盟等形式，在国内外逐步形成多个活跃的学术合作网络和科研交流平台；“员工至上，科技为先，民主创新，和谐发展”的治所理念;营造了一个有利于青年人才成长和发展的环境。2009年，成立仅3年 的病原所被评为“全国医药卫生系统先进集体”；2014年入选“国家创新人才培养示范基地”。